38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03990 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03990  expressed protein  100 
 
 
364 aa  756    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  26.17 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  28.06 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  29.72 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  26.55 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  26.15 
 
 
255 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  26.71 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 
245 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  26.43 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  26.22 
 
 
243 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  25.1 
 
 
242 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
243 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
259 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.75 
 
 
280 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  26.41 
 
 
252 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
239 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
239 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
239 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  25.13 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  24.91 
 
 
256 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  28.66 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
257 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  28.66 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  28.66 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  28.66 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  28.66 
 
 
251 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  22.81 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  28.05 
 
 
251 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  28.74 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.67 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.45 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
256 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 
254 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>