74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1188 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  100 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  63.79 
 
 		 625 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  47.19 
 
 		 607 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  43.85 
 
 		 371 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  46.41 
 
 		 613 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  40.33 
 
 		 620 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  30.31 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  27.67 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.86 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.67 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  27.11 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  23.22 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  27.75 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.1 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.32 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1094 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.57 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  24.48 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.76 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.39 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.02 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  25.29 
 
 		 332 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  23.61 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  25.63 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 1037 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.54 
 
 		 672 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  26.67 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  26.05 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0756  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.83 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.22 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.34 
 
 		 345 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  33.98 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  23.22 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.54 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  25.5 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.56 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  36.76 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  22.58 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  23.39 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.58 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  36 
 
 		 217 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  25.45 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>