110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1217 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  100 
 
 
607 aa  1211    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  38.58 
 
 
613 aa  310  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  36.97 
 
 
620 aa  307  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  45.29 
 
 
625 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  42.33 
 
 
371 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  47.19 
 
 
303 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
358 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  25.1 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  29.74 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.52 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.52 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.27 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.49 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.24 
 
 
303 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
286 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.89 
 
 
274 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  24.64 
 
 
323 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  27.47 
 
 
248 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.11 
 
 
240 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  22.59 
 
 
317 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
342 aa  64.7  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
330 aa  63.9  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
1094 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.9 
 
 
305 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.91 
 
 
303 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  23.2 
 
 
332 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  25.7 
 
 
318 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
214 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.33 
 
 
306 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.13 
 
 
275 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  20.41 
 
 
298 aa  57  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
333 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0756  methyltransferase type 11  24.54 
 
 
289 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.03 
 
 
310 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.48 
 
 
303 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 
273 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 
256 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.11 
 
 
287 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.9 
 
 
323 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
323 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.08 
 
 
305 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.87 
 
 
1177 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  20.89 
 
 
329 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  21.83 
 
 
391 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 
310 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
1177 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  21.41 
 
 
672 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.79 
 
 
277 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.48 
 
 
308 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28 
 
 
382 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.3 
 
 
235 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
235 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1190  hypothetical protein  50.94 
 
 
330 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  24.55 
 
 
285 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 
314 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
251 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.41 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.93 
 
 
273 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  20.93 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.07 
 
 
200 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  26.23 
 
 
447 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
222 aa  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  26.23 
 
 
447 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
238 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.67 
 
 
237 aa  48.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.18 
 
 
345 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  21.12 
 
 
396 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  22.8 
 
 
310 aa  47.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  23.64 
 
 
407 aa  47.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
383 aa  47.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
232 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.67 
 
 
239 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.84 
 
 
236 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.67 
 
 
232 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.71 
 
 
297 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.52 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
232 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  27.8 
 
 
287 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  27.7 
 
 
477 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  21.8 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 
232 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.68 
 
 
256 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  28.57 
 
 
621 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 
242 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  22.58 
 
 
316 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 
211 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  23.58 
 
 
281 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.62 
 
 
298 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.58 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 
245 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
282 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.68 
 
 
240 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26.32 
 
 
1635 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 
239 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.36 
 
 
236 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>