198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1253 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  523  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  31.4 
 
 		 621 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 689 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3355  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  31.65 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 442 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 442 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.68 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  24.65 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  28.85 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.93 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  28.85 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  30.05 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4300  hypothetical protein  23.39 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 436 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 2112 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  28.3 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1905  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.2 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  26.43 
 
 		 653 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  33.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  25.23 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  27.56 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.93 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.7 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  27.52 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 996 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  26.7 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.52 
 
 		 353 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 		 1523 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 353 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 358 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.08 
 
 		 345 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.17 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.6 
 
 		 356 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.16 
 
 		 345 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  24.36 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 353 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  26.75 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.59 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26 
 
 		 344 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  25.68 
 
 		 541 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  27.74 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  21.78 
 
 		 1287 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  23.86 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.11 
 
 		 580 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  26 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  40 
 
 		 323 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 323 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.52 
 
 		 200 aa  45.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  33.93 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  27.62 
 
 		 543 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.27 
 
 		 446 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 711 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.09 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>