145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3781 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  35.37 
 
 
672 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.22 
 
 
308 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  40.26 
 
 
298 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 
300 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 
305 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 
298 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  31.08 
 
 
332 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  30.22 
 
 
298 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.18 
 
 
345 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
303 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28 
 
 
330 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  24.85 
 
 
310 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
323 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  43.48 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
336 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
323 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
333 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
275 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
394 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.58 
 
 
285 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.73 
 
 
229 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
261 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  34.21 
 
 
353 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
353 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  26.47 
 
 
447 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
996 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  26.47 
 
 
447 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  32.53 
 
 
229 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
324 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
267 aa  51.6  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  32.53 
 
 
229 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
291 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  44.83 
 
 
1312 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  33.73 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  32.53 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  29.89 
 
 
298 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  26.46 
 
 
318 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
282 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  31.33 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  31.33 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  31.33 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  31.33 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
335 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  25.55 
 
 
316 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
273 aa  48.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  30.39 
 
 
297 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0108  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
232 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1303  conserved hypothetical protein, methyltransferase type 12 domain  30 
 
 
300 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.193595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
572 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  29.67 
 
 
246 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0098  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  30 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  28.41 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  30.38 
 
 
274 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  26.43 
 
 
310 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.49 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  31.73 
 
 
305 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  30.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  30 
 
 
248 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  25.37 
 
 
229 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 
415 aa  45.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  25.93 
 
 
318 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.02 
 
 
238 aa  45.1  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  24.16 
 
 
306 aa  45.1  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
681 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  22.03 
 
 
279 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 
543 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  23.27 
 
 
457 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  44.7  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  31.51 
 
 
395 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  32.43 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  35.8 
 
 
354 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.14 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  23.74 
 
 
358 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  26.25 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
624 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  24.31 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
286 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  24.64 
 
 
318 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  48.78 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
354 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>