127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0201 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  100 
 
 
216 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  93.06 
 
 
217 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  93.95 
 
 
223 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  92.59 
 
 
213 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  77.62 
 
 
212 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  77.14 
 
 
212 aa  350  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  78.57 
 
 
212 aa  346  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  76.67 
 
 
212 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  76.67 
 
 
212 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  57.62 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  57.14 
 
 
211 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  54.98 
 
 
211 aa  258  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  55.98 
 
 
214 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  51.43 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  54.63 
 
 
213 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  50 
 
 
222 aa  214  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  48.31 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  47.62 
 
 
212 aa  207  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  46.92 
 
 
214 aa  204  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  46.45 
 
 
215 aa  201  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  45.24 
 
 
223 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  46.19 
 
 
212 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  46.92 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  43.54 
 
 
257 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  45.24 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  43.96 
 
 
225 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  42.18 
 
 
215 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  39.61 
 
 
230 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  39.23 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  39.9 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.61 
 
 
214 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  33.81 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  35.07 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  35.51 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  35.51 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  34.6 
 
 
212 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  35.05 
 
 
212 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  34.11 
 
 
212 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  34.11 
 
 
212 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  34.11 
 
 
212 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.81 
 
 
232 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  32.71 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  30.95 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  33.64 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.54 
 
 
214 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  30.84 
 
 
223 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 
672 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.19 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.77 
 
 
345 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.58 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.27 
 
 
291 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.46 
 
 
306 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  21.72 
 
 
332 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.01 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 
333 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  21.93 
 
 
334 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
336 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  20.17 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  21.61 
 
 
273 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  23.93 
 
 
342 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  27.73 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  23.25 
 
 
574 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  22.42 
 
 
358 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  30.07 
 
 
1046 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  22.86 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.27 
 
 
274 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  25 
 
 
317 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.95 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 
310 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  22.49 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
323 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  24.26 
 
 
275 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  23.94 
 
 
305 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 
298 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
323 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.88 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  31.78 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
1177 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  18.7 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  23.66 
 
 
306 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  26.39 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  33.33 
 
 
621 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.57 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3274  hypothetical protein  26.47 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
711 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  28.33 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
310 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.14 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>