64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4727 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  93.87 
 
 		 212 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  93.87 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  93.87 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  83.02 
 
 		 212 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  82.55 
 
 		 212 aa  373  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  82.55 
 
 		 212 aa  373  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  82.08 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  83.96 
 
 		 212 aa  363  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  66.98 
 
 		 220 aa  299  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  61.79 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  61.32 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  58.49 
 
 		 232 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  61.5 
 
 		 222 aa  268  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  57.08 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  52.56 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  38.6 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  37.67 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  35.98 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  36.28 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  40.28 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  35.38 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  33.8 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  31.6 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  31.13 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  30.19 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.03 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  28.04 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  23.56 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  33.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  22.81 
 
 		 286 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  23.5 
 
 		 346 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  25.55 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 746 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 353 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  24.86 
 
 		 353 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.79 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 322 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.23 
 
 		 345 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 336 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>