73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1150 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  100 
 
 
222 aa  463  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  61.35 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  54.55 
 
 
223 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  50.95 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  46.7 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  44.5 
 
 
215 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
212 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  43.13 
 
 
233 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  40.19 
 
 
214 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  39.52 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  39.15 
 
 
217 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  45.24 
 
 
215 aa  174  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  42.51 
 
 
212 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  43 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  39.9 
 
 
211 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  38.03 
 
 
223 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  38.86 
 
 
213 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  38.94 
 
 
211 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  41.55 
 
 
225 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  39.61 
 
 
212 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
211 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  38.58 
 
 
215 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  37.8 
 
 
212 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  37.2 
 
 
212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  37.14 
 
 
211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  41.26 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  41.15 
 
 
213 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.02 
 
 
214 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  34.29 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  36.19 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  36.45 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  36.45 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  36.45 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  36.79 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  35.85 
 
 
212 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  33.65 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  33.65 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  31.39 
 
 
220 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  29.68 
 
 
232 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.34 
 
 
214 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  30.14 
 
 
222 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  29.05 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
271 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
330 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
265 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0296  hypothetical protein  20.82 
 
 
283 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.18 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.21 
 
 
345 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.52 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  22.09 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  36.11 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  25.82 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  21.76 
 
 
406 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  29.06 
 
 
258 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
335 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 
273 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
285 aa  41.6  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
317 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>