56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4293 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  97.64 
 
 
212 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  91.98 
 
 
212 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  83.02 
 
 
212 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  82.55 
 
 
212 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  83.02 
 
 
212 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  81.6 
 
 
212 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  66.51 
 
 
220 aa  295  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  59.91 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  60.85 
 
 
220 aa  278  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  61.79 
 
 
222 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  61.97 
 
 
222 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  56.6 
 
 
226 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  53.95 
 
 
223 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  35.07 
 
 
222 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  37.67 
 
 
214 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
212 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  36.79 
 
 
233 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  36.71 
 
 
257 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  32.23 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  31.9 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  36.97 
 
 
225 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  34.3 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  36.19 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
217 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  34.29 
 
 
213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
223 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  34.74 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
230 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  31.1 
 
 
215 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  35.55 
 
 
214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  30.81 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
212 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  32.06 
 
 
212 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
215 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  30 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
211 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.54 
 
 
214 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  29.1 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  29.86 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  24.04 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  23.85 
 
 
336 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  25.4 
 
 
258 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  26.92 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
746 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.98 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>