65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3946 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  67.92 
 
 		 212 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  67.61 
 
 		 212 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  66.98 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  66.51 
 
 		 212 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  66.04 
 
 		 212 aa  294  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  66.04 
 
 		 212 aa  294  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  66.04 
 
 		 212 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  66.04 
 
 		 212 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  56.5 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  54.59 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  56.62 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  54.59 
 
 		 226 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  53.21 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  54.34 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  36.41 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  36.79 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  37.5 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  35.55 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  34.76 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  36.28 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  33.49 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  35.85 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  31.9 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  32.55 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  29.95 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  33.79 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.54 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  30.64 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  21.63 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  23.58 
 
 		 336 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.24 
 
 		 273 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 271 aa  48.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.89 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  32.84 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.76 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  21.6 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  31.34 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.54 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  24.89 
 
 		 392 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.37 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 317 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>