103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2405 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  100 
 
 		 222 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  73.58 
 
 		 212 aa  345  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  74.06 
 
 		 212 aa  345  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  69.52 
 
 		 212 aa  318  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  56.07 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  55.56 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  52.17 
 
 		 215 aa  238  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  50.48 
 
 		 217 aa  235  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  52.17 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  51.66 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  49.76 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  50 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 216 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  48.34 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  48.33 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  48.11 
 
 		 213 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  49.52 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  44.93 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  50.24 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  48.57 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  47.14 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  49.29 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  48.82 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  48.56 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  42.92 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  44.29 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  44.71 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  39.52 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  39.07 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  42.51 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  38.6 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  38.6 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  37.67 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  35.81 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  35.81 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  35.81 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  35.81 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  34.74 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  36.28 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  34.29 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  35.24 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.17 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  32.38 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  32.81 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.66 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.62 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.45 
 
 		 329 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.88 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.18 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  22.87 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.89 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  26.18 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  21.89 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.76 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 		 241 aa  45.1  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  20.76 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  23.24 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.74 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  22.27 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 1287 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.32 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  28.87 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.47 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.89 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.47 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 353 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  24 
 
 		 353 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.1 
 
 		 230 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2304  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 		 241 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>