74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3583 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  100 
 
 		 211 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  60.19 
 
 		 211 aa  280  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  58.1 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  56.19 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  56.67 
 
 		 223 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  60 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  56.67 
 
 		 212 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  56.4 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  56.87 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  55.45 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  55.45 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  51.66 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  49.05 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  52.68 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  45.75 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  48.11 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  47.39 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  46.86 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  42.31 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  42.11 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  42.65 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  41.23 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  41.83 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.04 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  34.42 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  32.7 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  30.81 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  32.7 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  31.43 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  31.9 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  32.09 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  29.86 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  29.86 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  29.86 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  30.33 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  30.81 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.4 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  29.3 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.98 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 1312 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.52 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  23.95 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  35.56 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.18 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.62 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  36.78 
 
 		 1046 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.25 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  19.64 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 353 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.4 
 
 		 353 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  18.55 
 
 		 286 aa  42  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  23.91 
 
 		 2490 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 249 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 251 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.46 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 254 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  26.55 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>