58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0056 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  70 
 
 		 232 aa  335  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  63.64 
 
 		 222 aa  298  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  60.45 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  60.85 
 
 		 212 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  59.91 
 
 		 212 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  59.91 
 
 		 212 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  61.32 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  59.43 
 
 		 212 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  60.85 
 
 		 212 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  60.38 
 
 		 212 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  60.85 
 
 		 212 aa  265  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  59.43 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  52.94 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  53.21 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  45.66 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  34.74 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  36.41 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  34.58 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  34.74 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  35.35 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  37.68 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  29.67 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.51 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  30 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  27.7 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  28.11 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  21.95 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  23.73 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  20.96 
 
 		 286 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  31.75 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 333 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  30.68 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.24 
 
 		 329 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>