74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0259 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  100 
 
 		 211 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  62.38 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  60.48 
 
 		 211 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  58.1 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  56.4 
 
 		 217 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  56.19 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  56.67 
 
 		 212 aa  261  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  54.98 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  54.98 
 
 		 216 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  58.1 
 
 		 212 aa  251  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  53.81 
 
 		 212 aa  251  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 212 aa  247  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  56.67 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  53.85 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  44.29 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  44.29 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  44.29 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  43.81 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  43.13 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  41.63 
 
 		 257 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  43.6 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  45.67 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  41.04 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  39.9 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  40.87 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  40.1 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.5 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  31.31 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  33.16 
 
 		 214 aa  111  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  29.05 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  28.1 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  29.05 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  28.17 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  26.82 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  26.17 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  28.11 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  21.7 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.76 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.15 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.02 
 
 		 672 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  24.55 
 
 		 300 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  30.53 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  21.79 
 
 		 332 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 2490 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.78 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.68 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.84 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.77 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  23.21 
 
 		 358 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  22.88 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  21.88 
 
 		 354 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  21.99 
 
 		 305 aa  41.2  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  39.34 
 
 		 308 aa  41.2  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>