132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3944 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  100 
 
 		 212 aa  446  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  93.87 
 
 		 212 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  94.34 
 
 		 212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  88.21 
 
 		 212 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  78.57 
 
 		 216 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  78.57 
 
 		 223 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  76.89 
 
 		 213 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  77.14 
 
 		 217 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  76.19 
 
 		 212 aa  342  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  57.35 
 
 		 211 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  58.1 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  56.87 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  59.72 
 
 		 214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  51.43 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  56.94 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  50 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  49.52 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  48.57 
 
 		 212 aa  207  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  47.39 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  48.79 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  46.01 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  44.5 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  45.97 
 
 		 233 aa  191  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  47.14 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  42.31 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  44.93 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  40.19 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.1 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  33.65 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  31.13 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.81 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  32.55 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  32.86 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  32.55 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  32.55 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  32.55 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  34.93 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  32.55 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  32.71 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.73 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  31.48 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 1177 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.61 
 
 		 345 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 		 1177 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24 
 
 		 672 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  32.28 
 
 		 358 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  22.76 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.27 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  30.08 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.21 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 1312 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.9 
 
 		 333 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.5 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  21.1 
 
 		 248 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  27.34 
 
 		 310 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  33.72 
 
 		 621 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 440 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 1287 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 298 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.76 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  28.06 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.93 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.76 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.71 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  20.61 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  29.59 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  25.81 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.68 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.68 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.68 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  21.08 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.64 
 
 		 305 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>