50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3623 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  56.5 
 
 		 220 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  53.95 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  53.95 
 
 		 212 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  52.56 
 
 		 212 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  53.49 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  53.02 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  53.02 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  52.56 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  52.56 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  53.02 
 
 		 212 aa  224  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  48.4 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  48.18 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  46.15 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  46.58 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  48.4 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  33.49 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  33.18 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  30.84 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  28.64 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 257 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  30.99 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  28.77 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  29.77 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  30.62 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  28.17 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  28.64 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  25.94 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  29.65 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.05 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  29.05 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  20.95 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>