71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0514 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  56.52 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  55.56 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  54.11 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  50.72 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  50 
 
 		 217 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  48.79 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  48.33 
 
 		 214 aa  211  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  47.34 
 
 		 215 aa  201  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  46.86 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  48.79 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  45.89 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  47.34 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  46.86 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  45.41 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  44.55 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  46.38 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  44.71 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  43.81 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  45.41 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  44.44 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  41.94 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  43.35 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  41.55 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  44.93 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  38.86 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  39.34 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  37.44 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  37.44 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.96 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  36.97 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  36.97 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  36.97 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  36.23 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  37.68 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  36.71 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  35.85 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  34.76 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  32.85 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  36.65 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.55 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  31.31 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.07 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  21.3 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1757  hypothetical protein  23.08 
 
 		 601 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.309214  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 		 1177 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  23.37 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  27.74 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 2490 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  21.59 
 
 		 1177 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.17 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  21.67 
 
 		 672 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  29.41 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 333 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 310 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>