57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06720 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  100 
 
 
214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  36.79 
 
 
223 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  34.52 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  36.1 
 
 
213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  34.8 
 
 
230 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  35.96 
 
 
225 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
216 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  35.12 
 
 
217 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  33.5 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  35.12 
 
 
223 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  36 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  36.6 
 
 
212 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  35.05 
 
 
214 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  37.38 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  33.68 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  34.15 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  36.02 
 
 
222 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  34.47 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  36.1 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  36.41 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  33.5 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  32.31 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
217 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  33.17 
 
 
222 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  34.74 
 
 
212 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  34.47 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
214 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  34.21 
 
 
212 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  32.04 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  33.98 
 
 
213 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  30.54 
 
 
220 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
217 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  32.02 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  32.02 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  31.03 
 
 
212 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  31.03 
 
 
212 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33 
 
 
232 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  32.51 
 
 
220 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  30.54 
 
 
222 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  28.5 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  32.84 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  27.04 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  25.76 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  27.05 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  26.78 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.73 
 
 
2490 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
263 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  23.48 
 
 
271 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  24.27 
 
 
287 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  38.57 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.448559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>