182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0344 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 268 aa  557  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  62.45 
 
 		 266 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  52.09 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  48.29 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  46.18 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 		 1077 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  40.23 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  36.17 
 
 		 664 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  39.74 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  35.11 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  35.11 
 
 		 678 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  36.59 
 
 		 615 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  31.68 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  33.33 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  36.36 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  33.71 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  29 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  29.36 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  41.98 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  36.14 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  29.81 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  37.18 
 
 		 507 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  35.16 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 121 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  30.39 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  33.68 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  27.83 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  30.7 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.76 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  27.18 
 
 		 161 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.88 
 
 		 127 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  24.77 
 
 		 166 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  26.32 
 
 		 174 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  51.92 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 109 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  29.63 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  26.72 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  21.7 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  27.36 
 
 		 190 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  29.07 
 
 		 139 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  26.42 
 
 		 179 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  23.85 
 
 		 180 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  24.43 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  26 
 
 		 131 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  22.66 
 
 		 169 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  23.36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.4 
 
 		 132 aa  48.9  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  25.23 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  25.71 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  27.93 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  26.67 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  27.93 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  27.93 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  22.03 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  26.61 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  27.93 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  27.93 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  27.93 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  26.92 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  21.53 
 
 		 181 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  29.87 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  28.7 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  28.7 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  21.19 
 
 		 160 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 130 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  27.12 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  26.47 
 
 		 174 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  28.74 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  28.85 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  26.13 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  27.27 
 
 		 161 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  23.85 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  24.55 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  31.08 
 
 		 171 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  31.08 
 
 		 131 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 164 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  27.64 
 
 		 192 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  25.47 
 
 		 167 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  25.23 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  24.82 
 
 		 201 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 		 143 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  28.97 
 
 		 130 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  27.36 
 
 		 140 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>