135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4550 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  447  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  90.09 
 
 		 212 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  90.09 
 
 		 212 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  88.21 
 
 		 212 aa  387  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  77.62 
 
 		 216 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  76.19 
 
 		 223 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  74.53 
 
 		 213 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  75.24 
 
 		 217 aa  343  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  74.29 
 
 		 212 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  56.4 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  56.4 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  53.81 
 
 		 211 aa  251  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  56.87 
 
 		 214 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  49.05 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  55.71 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  49.52 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  48.56 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  46.63 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  46.15 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  46.67 
 
 		 215 aa  191  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  44.76 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  42.58 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  44.17 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  39.23 
 
 		 257 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  39.61 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  38.05 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.47 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  35.1 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  31.13 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  32.21 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  30.66 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  32.69 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  32.06 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  31.13 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  28.85 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  30.56 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  30.99 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  32.55 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.24 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  29.77 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.21 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 1177 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.2 
 
 		 672 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.6 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  27.67 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 335 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 		 1177 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  38.05 
 
 		 323 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.21 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.72 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.76 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.76 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  28.37 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.41 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.17 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3274  hypothetical protein  30.39 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  24.46 
 
 		 297 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 298 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.97 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  24.68 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 324 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  25.14 
 
 		 258 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.33 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.48 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  30.63 
 
 		 1046 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  23.08 
 
 		 414 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  20.54 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>