63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00013 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  49.76 
 
 
222 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  47.17 
 
 
212 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  49.76 
 
 
212 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  46.92 
 
 
214 aa  205  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  46.01 
 
 
215 aa  204  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  45.28 
 
 
212 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  46.23 
 
 
215 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  45.02 
 
 
223 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  46.23 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  46.92 
 
 
217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  46.92 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  43.66 
 
 
217 aa  195  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  45.97 
 
 
257 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  44.55 
 
 
225 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  45.02 
 
 
223 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  44.76 
 
 
212 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  45.97 
 
 
212 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  43.13 
 
 
222 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  45.97 
 
 
212 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  46.7 
 
 
212 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
211 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  39.81 
 
 
230 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  46.23 
 
 
212 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  41.23 
 
 
211 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  41.04 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  40.28 
 
 
211 aa  167  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  43.13 
 
 
215 aa  165  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
217 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  42.45 
 
 
213 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  36.79 
 
 
220 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  36.79 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  35.21 
 
 
232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  35.85 
 
 
212 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  35.85 
 
 
212 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  35.85 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36 
 
 
214 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  35.35 
 
 
220 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  33.49 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  33.18 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  31.94 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.23 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.17 
 
 
336 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  25.31 
 
 
300 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  24 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 
1177 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.71 
 
 
346 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  24.65 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  22.94 
 
 
306 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  22.83 
 
 
1177 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  21.43 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.88 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  26.99 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.82 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.09 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>