73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0892 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  100 
 
 
214 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  42.18 
 
 
214 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
214 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
217 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  33.99 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  34.27 
 
 
215 aa  118  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  31.8 
 
 
211 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  31 
 
 
222 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  32.51 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  32.51 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  32.55 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  29 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  28 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
217 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 
216 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  30.54 
 
 
213 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
230 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
222 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  30.24 
 
 
212 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
217 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  27.4 
 
 
211 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  27.49 
 
 
215 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  30.24 
 
 
212 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  26.24 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  27.23 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  26.82 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
257 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  29.56 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  25.76 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  24.04 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  22.12 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
2490 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  21.63 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  20.49 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  26 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  21.95 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  25.11 
 
 
226 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  22.17 
 
 
222 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  22.49 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  23.92 
 
 
396 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.19 
 
 
278 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  20.95 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  20.1 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  22.15 
 
 
391 aa  48.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  30.19 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  21.76 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0756  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  21.62 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.04 
 
 
273 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  28.18 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  23.85 
 
 
308 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.62 
 
 
345 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
212 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 
310 aa  41.6  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  25.12 
 
 
300 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  41.67 
 
 
1046 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>