261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1330 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  61.9 
 
 
217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  61.24 
 
 
216 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  61.24 
 
 
216 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  60.29 
 
 
213 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  60 
 
 
215 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  53.95 
 
 
221 aa  241  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  53.02 
 
 
279 aa  229  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  53.02 
 
 
218 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  51.92 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  48.8 
 
 
217 aa  204  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  50.96 
 
 
215 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  53.26 
 
 
217 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  53.3 
 
 
217 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  53.01 
 
 
211 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  47.64 
 
 
217 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  44.02 
 
 
216 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  43.54 
 
 
216 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  42.18 
 
 
213 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  40.19 
 
 
212 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  40.38 
 
 
212 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  39.42 
 
 
214 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  39.9 
 
 
212 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  40.19 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  42.63 
 
 
229 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  42.29 
 
 
209 aa  158  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  39.13 
 
 
214 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  42.08 
 
 
350 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  42.31 
 
 
225 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 
315 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  41.63 
 
 
219 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  38.94 
 
 
207 aa  138  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
402 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  41.9 
 
 
412 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 
399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
237 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  35.88 
 
 
403 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  23.23 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  53.33 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  29.82 
 
 
272 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.1 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  52.08 
 
 
283 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 
1106 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1205  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.78 
 
 
249 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.836419  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  50 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  47.92 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  54.55 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  31.65 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
238 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 
249 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
269 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
511 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  47.92 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
250 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  24.81 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0468  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.48 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  43.48 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.86 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.48 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  24.81 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  47.62 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  43.48 
 
 
238 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
267 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  47.92 
 
 
197 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
235 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
236 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  28 
 
 
217 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  38.6 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  45.59 
 
 
658 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  26.74 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  39.66 
 
 
331 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  44.19 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  51.16 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  31.15 
 
 
274 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>