76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1735 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1735  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  37.21 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  36.05 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.04 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.04 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  28.37 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  32 
 
 		 429 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 487 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 290 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  34.94 
 
 		 260 aa  47.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.01 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 262 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 262 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  30.65 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0842  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  57.89 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.48 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 257 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  33.96 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 257 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 310 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  48.84 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  53.85 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 262 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 257 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  25.3 
 
 		 283 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 262 aa  44.7  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 276 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.7 
 
 		 282 aa  44.3  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  25.41 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  29.27 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.28 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.52 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.91 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 332 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.25 
 
 		 312 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  30 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.95 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 281 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 282 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0944  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase  25.16 
 
 		 263 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 219 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  33.64 
 
 		 202 aa  41.2  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 210 aa  41.2  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 247 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 268 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0086  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0770264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 241 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 269 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>