More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3472 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  96.89 
 
 		 261 aa  517  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  93.39 
 
 		 260 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  87.11 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  87.89 
 
 		 257 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  87.11 
 
 		 257 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  86.72 
 
 		 257 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  85.43 
 
 		 257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  74.8 
 
 		 254 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  70.59 
 
 		 256 aa  400  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  68.63 
 
 		 284 aa  367  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  63.39 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  45.63 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  46.4 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  46.4 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  46.4 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  46.4 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  46.4 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  45.02 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  45.42 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  45.02 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  44.44 
 
 		 278 aa  224  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  42.23 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  42.63 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  42.63 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  42.63 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  41.83 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  40.64 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  38.87 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  40.71 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  39.84 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  40.77 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  37.7 
 
 		 247 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  35.83 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  37.45 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  39.13 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  40.08 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  39.29 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  39.3 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  36.9 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  37.5 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  34.74 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  34.27 
 
 		 199 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.89 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.89 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.65 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  27.64 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  30.16 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.27 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.82 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.82 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  34.13 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.01 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  34.13 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  34.13 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.96 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  31.51 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.4 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>