67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0086 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0086  methyltransferase type 11  100 
 
 
186 aa  368  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0770264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0119  methyltransferase type 11  71.51 
 
 
184 aa  259  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00979583 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0126  methyltransferase type 11  74.84 
 
 
159 aa  248  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1163  methyltransferase type 11  73.12 
 
 
198 aa  246  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.835345  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0994  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.430888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
237 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1777  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  25.6 
 
 
233 aa  51.6  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1298  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
237 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.96 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
273 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4129  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0406276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
225 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
487 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
216 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
258 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1711  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
208 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
240 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.02 
 
 
235 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  30.08 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  30.08 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.48 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
222 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  32.35 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.07 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  31.93 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2167  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
394 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  32.89 
 
 
299 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1067  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  47.73 
 
 
367 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
290 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
249 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1953  Methyltransferase type 11  50 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.520694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  35.48 
 
 
241 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
249 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
224 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
283 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
264 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0764  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
199 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.855881  decreased coverage  0.00371896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0306  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
262 aa  41.6  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.97 
 
 
243 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.69 
 
 
235 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0456  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
371 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.25 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.1 
 
 
229 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  35.24 
 
 
202 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
263 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
204 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
252 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
204 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 
243 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>