More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1953 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1953  Methyltransferase type 11  100 
 
 
191 aa  364  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.520694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  53.48 
 
 
190 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
267 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
186 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.97 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
327 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.35 
 
 
235 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.35 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.1 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.4 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  40.14 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.49 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.81 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.81 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.33 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.47 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  39.16 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.52 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5258  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.45 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  31.28 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.35 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.3 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  43.28 
 
 
352 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.69 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.63 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.59 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
265 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
339 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.64 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 
240 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  48.57 
 
 
268 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.39 
 
 
503 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  36.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.92 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.86 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.86 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
266 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  39.01 
 
 
354 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39.01 
 
 
349 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
238 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.32 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  36.99 
 
 
241 aa  62  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  33.12 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 
231 aa  61.6  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  31.52 
 
 
202 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
260 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
265 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
248 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.03 
 
 
231 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
275 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.62 
 
 
237 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 
219 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  30.6 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.1 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
248 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  36.15 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  30 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.75 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
282 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
279 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.89 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
244 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>