139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1711 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1711  methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0133  Methyltransferase type 11  51.05 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285764 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2191  hypothetical protein  40.91 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_002936  DET0041  quinone methlytransferase  36.6 
 
 		 168 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000105816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  30.46 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  30.43 
 
 		 363 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  30.36 
 
 		 351 aa  52  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.32 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 363 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 		 299 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  24.32 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  36.84 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 327 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  28.57 
 
 		 357 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 362 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1231  hypothetical protein  40.54 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.08 
 
 		 328 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 363 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.63 
 
 		 351 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  32.18 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 339 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 286 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.4 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.68 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.67 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.67 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  43.66 
 
 		 312 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  29.57 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  36.96 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.5 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  29.79 
 
 		 353 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.33 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  30 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  28.72 
 
 		 353 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0086  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0770264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.78 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  30.91 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3642  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 355 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000500593  decreased coverage  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.73 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.86 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  39.77 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  32.74 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  26.05 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.96 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.9 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  40.66 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  29 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.04 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.04 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  27.66 
 
 		 352 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.51 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  44.29 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.75 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  41.89 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.8 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  38.96 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4204  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.69 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>