187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0662 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  86.58 
 
 
231 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  85.28 
 
 
235 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  71 
 
 
231 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.61 
 
 
231 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.83 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 
227 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.28 
 
 
226 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  36.32 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  34.05 
 
 
226 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  32.17 
 
 
223 aa  121  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  27.66 
 
 
222 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  26.96 
 
 
223 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  25.43 
 
 
224 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  26.41 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.11 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  27.49 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.33 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.46 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.93 
 
 
294 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.7 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.11 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  22.76 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.44 
 
 
269 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.9 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.85 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.05 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.96 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.7 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.4 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.4 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.62 
 
 
260 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.07 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.07 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.66 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.18 
 
 
250 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.09 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  26.59 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.15 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  25.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.22 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.81 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  20.21 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  22.17 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.73 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.52 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.09 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.76 
 
 
249 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  30.33 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 
265 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.16 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.35 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.11 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.03 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
268 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.02 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  27.55 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.35 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  46 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  33.33 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.73 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.34 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.72 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  29.37 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.59 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.35 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  29.47 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.88 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  34.67 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.53 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  24.07 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  24.4 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  30.85 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 
333 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.71 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.59 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.59 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.32 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.69 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  27.61 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.28 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.76 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.96 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  42 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  23.08 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.72 
 
 
262 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>