125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0817 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  968    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 573 aa  90.9  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  32 
 
 		 604 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  29 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 612 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  36 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1883  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.03 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  33.94 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.84 
 
 		 936 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  29.8 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 864 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.17 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  40.38 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3142  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  27.1 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.88 
 
 		 816 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.98 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  32.32 
 
 		 199 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 878 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  26.9 
 
 		 209 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.54 
 
 		 810 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  28.3 
 
 		 206 aa  54.3  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  25.35 
 
 		 937 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  30.21 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  27.03 
 
 		 210 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  32.61 
 
 		 226 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 667 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  28.04 
 
 		 233 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.74 
 
 		 795 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.09 
 
 		 725 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 1069 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 909 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.5 
 
 		 632 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 884 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  26.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 681 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.39 
 
 		 1979 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.7 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  29.68 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 685 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.96 
 
 		 865 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 538 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  25.64 
 
 		 550 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 465 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.72 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 318 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  37.88 
 
 		 990 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  37.88 
 
 		 990 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.22 
 
 		 864 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 739 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  23.65 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 886 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 		 604 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 968 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  25.76 
 
 		 227 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.78 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 646 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.9 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  23.46 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 934 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1770  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.679199  normal  0.0353666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 643 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 		 1213 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  36.36 
 
 		 990 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  28.18 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  36.36 
 
 		 990 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07051  hypothetical protein  29.59 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 562 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.23 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>