22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2117 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  51.41 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  27.54 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  40.38 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  34.81 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  32.54 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  31.13 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 597 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  27.1 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 573 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 480 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 503 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6246  hypothetical protein  29.7 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  32.41 
 
 		 535 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  25.66 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  32.08 
 
 		 467 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  28.26 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0873  hypothetical protein  32.17 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1770  hypothetical protein  30.91 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.679199  normal  0.0353666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>