23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1295 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  376  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  52.98 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  33.91 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  34.68 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  37.5 
 
 		 467 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  29.63 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  32.06 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  30.65 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 597 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.97 
 
 		 936 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 480 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  35.14 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  30.56 
 
 		 467 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 503 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  30 
 
 		 604 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  29.57 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.19 
 
 		 535 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.39 
 
 		 594 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  30.09 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 573 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1883  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 457 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 596 aa  40.8  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>