17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0596 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  75.12 
 
 
206 aa  332  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  73.3 
 
 
241 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  58.42 
 
 
210 aa  241  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  55 
 
 
199 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  52.24 
 
 
199 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  31.46 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  34.62 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  25.59 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  33.91 
 
 
180 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  32.54 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  28.04 
 
 
467 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
480 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
597 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  22.84 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1296  hypothetical protein  25.44 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482431  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  26.89 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>