15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0873 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1770  hypothetical protein  73.95 
 
 		 237 aa  367  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.679199  normal  0.0353666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07051  hypothetical protein  68.07 
 
 		 238 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  28.44 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  29.03 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 480 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 597 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  26.02 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  26.64 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 467 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16241  hypothetical protein  31.9 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.093225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46348  predicted protein  28.1 
 
 		 401 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  32.17 
 
 		 224 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  30.21 
 
 		 535 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3142  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 504 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>