17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1770 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.679199  normal  0.0353666 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0873  hypothetical protein  73.84 
 
 		 228 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07051  hypothetical protein  73.14 
 
 		 238 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  31.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 480 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  31.58 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 597 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3142  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 504 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  30.39 
 
 		 535 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  28.28 
 
 		 467 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  29.91 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  26.5 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  24.58 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16241  hypothetical protein  27.27 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.093225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46348  predicted protein  25.83 
 
 		 401 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  31.46 
 
 		 467 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  28.57 
 
 		 604 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>