17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0259 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  78.64 
 
 		 241 aa  344  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  75.12 
 
 		 233 aa  332  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  59.2 
 
 		 210 aa  237  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  56.22 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  52.5 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  32.31 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  25.53 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  28.3 
 
 		 467 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  30.65 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  28.7 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  27.1 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  24.48 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 573 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2170  hypothetical protein  27.46 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2232  hypothetical protein  27.46 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>