16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2170 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2170  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2232  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1296  hypothetical protein  36.91 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482431  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2186  hypothetical protein  37.17 
 
 
249 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.576025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0490  hypothetical protein  35.09 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0738  hypothetical protein  27.78 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00463376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  25.87 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1927  hypothetical protein  30.43 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  26.7 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  35.83 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  26.42 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  27.46 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  21.67 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
597 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  29.17 
 
 
604 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  25.87 
 
 
210 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.373723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>