17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6246 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6246  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  29.52 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  27.83 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46348  predicted protein  27.03 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  24.7 
 
 		 593 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 573 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0738  hypothetical protein  30.09 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00463376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.17 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30539  predicted protein  25.81 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0319771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.81 
 
 		 535 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1927  hypothetical protein  30.97 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  27.45 
 
 		 604 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  25.42 
 
 		 467 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  25.81 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 596 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>