18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0738 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0738  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00463376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1927  hypothetical protein  75.45 
 
 
225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0490  hypothetical protein  34.48 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1296  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482431  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2186  hypothetical protein  33.62 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.576025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2232  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2170  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  27.75 
 
 
199 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.93 
 
 
594 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.27 
 
 
936 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
503 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
480 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  32.48 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  25.85 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6246  hypothetical protein  30.09 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.300943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  34.02 
 
 
535 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  26.54 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>