166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1218 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  85.05 
 
 		 602 aa  962    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1201    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  41.53 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  40.22 
 
 		 499 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  41.83 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 545 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 536 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.51 
 
 		 545 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.35 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 545 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 571 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  37.74 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  31.84 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  35.45 
 
 		 705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 		 573 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 608 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 593 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.15 
 
 		 615 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  36.1 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  36.15 
 
 		 711 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  35.61 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1038 aa  166  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 780 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 740 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 747 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.49 
 
 		 1677 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 527 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 1005 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 615 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 639 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  31.71 
 
 		 872 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 648 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.91 
 
 		 502 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 502 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  32.57 
 
 		 389 aa  157  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 502 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.52 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 578 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.74 
 
 		 1077 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 767 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 635 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 635 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  32.05 
 
 		 360 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1212 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.58 
 
 		 611 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 747 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 955 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 636 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1450 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 688 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 636 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 637 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 		 360 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.87 
 
 		 1034 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 612 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 558 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 3145 aa  147  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  34.28 
 
 		 385 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  29.95 
 
 		 473 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 523 aa  144  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.6 
 
 		 620 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.32 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.66 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.05 
 
 		 760 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 614 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.65 
 
 		 626 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 689 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.19 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.03 
 
 		 626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.03 
 
 		 614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 935 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.03 
 
 		 614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.03 
 
 		 614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.84 
 
 		 1764 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 614 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>