166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2057 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2193  hypothetical protein  99.82 
 
 
552 aa  1084    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2057  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1087    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
1454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
1451 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.1 
 
 
1077 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
1450 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  36.99 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 
740 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
688 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
1827 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  35.33 
 
 
577 aa  163  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.48 
 
 
620 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.75 
 
 
1764 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
1212 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
523 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 
601 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
574 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.03 
 
 
578 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.41 
 
 
473 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
3145 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  32.96 
 
 
360 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  36.13 
 
 
648 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  33.44 
 
 
385 aa  156  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
1038 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
484 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 
653 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  27.29 
 
 
653 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 
1034 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
608 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
1005 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.82 
 
 
1677 aa  153  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
602 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
620 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  34.41 
 
 
499 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  33.64 
 
 
502 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
502 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  34.08 
 
 
492 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
520 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 
760 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
502 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.6 
 
 
454 aa  151  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
556 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  34.75 
 
 
389 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
595 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1173  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
747 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
412 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.39 
 
 
872 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
529 aa  143  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
955 aa  143  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
527 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.07 
 
 
703 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
636 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.59 
 
 
646 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.6 
 
 
626 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.17 
 
 
604 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
615 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  31.99 
 
 
630 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 
689 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
588 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 
592 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.23 
 
 
614 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.23 
 
 
614 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
614 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.23 
 
 
626 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
614 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.23 
 
 
626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  32.17 
 
 
600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
614 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  32.01 
 
 
705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 
935 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
923 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.14 
 
 
615 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
639 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
573 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
571 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  32.29 
 
 
602 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
649 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
649 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
780 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
662 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 
540 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
646 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
593 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
611 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 
512 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
438 aa  124  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>