More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2854 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2854  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1097    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 740 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 608 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.72 
 
 		 620 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 1005 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 767 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 620 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 		 1034 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 955 aa  209  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 558 aa  207  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 681 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 602 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.48 
 
 		 703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 923 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 1450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 639 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 612 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 412 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 662 aa  194  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 1038 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 688 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 637 aa  190  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 714 aa  190  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 636 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1827 aa  187  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 574 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 		 649 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 		 649 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 646 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 611 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.64 
 
 		 1077 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 635 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 635 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.46 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 595 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.65 
 
 		 577 aa  180  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1212 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.89 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 714 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 529 aa  177  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 614 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 626 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 		 626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 		 614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 		 614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 3145 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.04 
 
 		 760 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 780 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 636 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.84 
 
 		 653 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 653 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 		 648 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 611 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 614 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  31.08 
 
 		 525 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 566 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.85 
 
 		 1677 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 747 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.05 
 
 		 387 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 935 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  37.74 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.81 
 
 		 550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.91 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 502 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 451 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.78 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  33.19 
 
 		 600 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  31.87 
 
 		 546 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.95 
 
 		 1764 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.79 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 545 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 573 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  31.49 
 
 		 872 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 1073 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  26.98 
 
 		 630 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>