19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0395 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  978    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  64.48 
 
 		 837 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  36.91 
 
 		 702 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  41.76 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2793  tetratricopeptide TPR_4  34.42 
 
 		 1024 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3707  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1020 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33203  normal  0.291068 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  40.54 
 
 		 1262 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1404 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 1185 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 911 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  41.79 
 
 		 1488 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  36 
 
 		 1507 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 1040 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  46.03 
 
 		 1105 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 1128 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  43.86 
 
 		 577 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  52 
 
 		 919 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>