17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3707 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3707  hypothetical protein  100 
 
 		 1020 aa  2026    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33203  normal  0.291068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2793  tetratricopeptide TPR_4  32.63 
 
 		 1024 aa  122  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.17 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  28.9 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 837 aa  64.3  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 		 599 aa  57.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  26.93 
 
 		 482 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0395  hypothetical protein  31.62 
 
 		 488 aa  51.6  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 653 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  31.4 
 
 		 653 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.66 
 
 		 363 aa  49.7  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.13 
 
 		 261 aa  48.9  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1032 aa  48.5  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 505 aa  47.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3982  hypothetical protein  35.45 
 
 		 494 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25 
 
 		 528 aa  44.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.63 
 
 		 393 aa  44.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>