More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1759 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1759  diguanylate cyclase  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0198551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 
1073 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.49 
 
 
355 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.87 
 
 
710 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  40.49 
 
 
718 aa  148  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  36.36 
 
 
764 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  35.91 
 
 
764 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
517 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  35.91 
 
 
764 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  43.45 
 
 
569 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  38.36 
 
 
615 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.35 
 
 
407 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0701  diguanylate cyclase  40 
 
 
650 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291224  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
498 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  41.57 
 
 
448 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  44.94 
 
 
555 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.22 
 
 
586 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  35.55 
 
 
487 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  34.94 
 
 
608 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0563  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.75 
 
 
846 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  35.4 
 
 
732 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  39.3 
 
 
462 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  41.24 
 
 
414 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.04 
 
 
797 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.92 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.93 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.01 
 
 
558 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.86 
 
 
578 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  36.05 
 
 
494 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  43.26 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  36.05 
 
 
494 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  37.55 
 
 
291 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  43.27 
 
 
294 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.01 
 
 
841 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  38.91 
 
 
836 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  36.44 
 
 
525 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.1 
 
 
557 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  40.96 
 
 
401 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.04 
 
 
473 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  33.63 
 
 
342 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  39.67 
 
 
753 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  37.1 
 
 
680 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  43.21 
 
 
630 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  46.25 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  40 
 
 
458 aa  131  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  43.11 
 
 
638 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.4 
 
 
848 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  40 
 
 
459 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  34.84 
 
 
307 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.75 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.75 
 
 
459 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  43.03 
 
 
738 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.44 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.44 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  35.57 
 
 
374 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  34.12 
 
 
356 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  37.18 
 
 
681 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  44.51 
 
 
462 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.27 
 
 
550 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.01 
 
 
792 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.77 
 
 
730 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  34.26 
 
 
369 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  39.61 
 
 
565 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 
1637 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.21 
 
 
499 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.55 
 
 
901 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.71 
 
 
557 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.92 
 
 
301 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2239  diguanylate cyclase  36.02 
 
 
387 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  33.65 
 
 
356 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
580 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  38.07 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1205  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.21 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3653  GGDEF  37.55 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.203802  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  40.8 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  33.18 
 
 
758 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.04 
 
 
1079 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  44.17 
 
 
565 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  40.2 
 
 
325 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.51 
 
 
531 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.83 
 
 
742 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.31 
 
 
564 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  34.23 
 
 
458 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.02 
 
 
866 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.378784  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.67 
 
 
563 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  43.67 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  39.89 
 
 
316 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  34.78 
 
 
493 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
717 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  41.52 
 
 
345 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1012  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
295 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
459 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6003  diguanylate cyclase  34.6 
 
 
371 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  0.321238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2393  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.19 
 
 
455 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  41.88 
 
 
350 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  34.25 
 
 
733 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0623  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.11 
 
 
556 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322116  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  35.68 
 
 
465 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1908  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.31 
 
 
519 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>