More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0691 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 
742 aa  1414    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  80.32 
 
 
753 aa  1051    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6322  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.93 
 
 
682 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314546  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.69 
 
 
710 aa  362  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0701  diguanylate cyclase  32.47 
 
 
650 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291224  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.2 
 
 
353 aa  161  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.21 
 
 
362 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  42.33 
 
 
609 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  42.33 
 
 
709 aa  157  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  43.94 
 
 
680 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.97 
 
 
355 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  40.19 
 
 
353 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  41.71 
 
 
439 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  32.52 
 
 
356 aa  153  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  32.52 
 
 
356 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
1073 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.89 
 
 
797 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  30.72 
 
 
555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  30.96 
 
 
688 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.02 
 
 
356 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.05 
 
 
704 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  33.14 
 
 
342 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.77 
 
 
713 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  42.31 
 
 
565 aa  147  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.09 
 
 
792 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.94 
 
 
494 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  43.56 
 
 
733 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  42.37 
 
 
273 aa  144  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  40.93 
 
 
615 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  38.14 
 
 
718 aa  143  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.82 
 
 
686 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.19 
 
 
415 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  43.33 
 
 
459 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  31.57 
 
 
808 aa  141  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.36 
 
 
459 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  43.33 
 
 
458 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  47.9 
 
 
457 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  50 
 
 
457 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  39.92 
 
 
785 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  38.89 
 
 
494 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
494 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.86 
 
 
550 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  43.24 
 
 
717 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  41.15 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  46.2 
 
 
681 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  32.94 
 
 
494 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  32.94 
 
 
494 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  44.81 
 
 
291 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  45.71 
 
 
580 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  41.55 
 
 
574 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  40 
 
 
374 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  39.66 
 
 
505 aa  137  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.12 
 
 
756 aa  137  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  38.71 
 
 
458 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.18 
 
 
505 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  41.55 
 
 
574 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  43.45 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.46 
 
 
473 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  44.62 
 
 
466 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2174  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.95 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.57 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  29.25 
 
 
681 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  48.82 
 
 
455 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  33.95 
 
 
836 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
471 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  45.09 
 
 
457 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.95 
 
 
841 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1260  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.58 
 
 
423 aa  134  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.58 
 
 
642 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  46.3 
 
 
457 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0963  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.11 
 
 
300 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.04 
 
 
1079 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.58 
 
 
322 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  35.44 
 
 
792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  40.53 
 
 
758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  29.13 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  40.87 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  43.96 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  44.51 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.01 
 
 
407 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  41.42 
 
 
294 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  41.62 
 
 
303 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  43.17 
 
 
866 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  37.67 
 
 
465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  38.86 
 
 
764 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  45.09 
 
 
457 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.98 
 
 
564 aa  131  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.64 
 
 
457 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0676  diguanylate cyclase  43.88 
 
 
550 aa  131  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260909  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  44.57 
 
 
457 aa  131  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  30.51 
 
 
646 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  38.33 
 
 
278 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  45.66 
 
 
316 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  42.35 
 
 
638 aa  130  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3087  diguanylate cyclase  45.03 
 
 
361 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.79 
 
 
675 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  36.11 
 
 
554 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  36.59 
 
 
1099 aa  130  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.8 
 
 
663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  44.51 
 
 
457 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>