249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2991 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  99.15 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  84.62 
 
 		 233 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2366  signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0197  putative signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1440  putative signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6262  signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  52.97 
 
 		 1063 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  51.21 
 
 		 1061 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  45.36 
 
 		 692 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 1111 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 1096 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 907 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  36.79 
 
 		 1096 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 792 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 601 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.38 
 
 		 1190 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 934 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 347 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 1039 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 571 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 575 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  37.13 
 
 		 1202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 713 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 635 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 577 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 550 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  33.18 
 
 		 930 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 620 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.17 
 
 		 1163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.33 
 
 		 842 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 930 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  34.87 
 
 		 499 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.5 
 
 		 583 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 583 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 1124 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  34.13 
 
 		 655 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 571 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 655 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 633 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.54 
 
 		 500 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 583 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1132 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  34.13 
 
 		 1132 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 550 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  36.79 
 
 		 620 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 500 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 759 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 728 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  35.18 
 
 		 728 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 387 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 725 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 586 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 867 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 561 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 850 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 655 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.87 
 
 		 1167 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  33.5 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 588 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 489 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 929 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 602 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 713 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 528 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  37.69 
 
 		 717 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  34.52 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 346 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.82 
 
 		 1168 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 488 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  34.36 
 
 		 624 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 		 1160 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 352 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 572 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 484 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 488 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 738 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 505 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  31.14 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 384 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 349 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 840 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 503 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 507 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 495 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30.3 
 
 		 844 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  29.47 
 
 		 856 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 1170 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  31.42 
 
 		 1170 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  31.19 
 
 		 852 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.26 
 
 		 846 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.13 
 
 		 844 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 512 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>