225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0197 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0197  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1440  putative signal transduction histidine kinase  59.13 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6262  signal transduction histidine kinase  55.7 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  51.54 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  50.88 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2366  signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  48.77 
 
 		 1061 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  45.32 
 
 		 1063 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  39.36 
 
 		 692 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.44 
 
 		 1190 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 583 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.65 
 
 		 583 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 907 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  34.65 
 
 		 728 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 601 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 728 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 662 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 583 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 387 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 571 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.51 
 
 		 842 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 588 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 713 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 		 733 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  34.62 
 
 		 856 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 575 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 1111 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 347 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 850 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 555 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 792 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 484 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  33.16 
 
 		 364 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.38 
 
 		 844 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1096 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 460 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  32.43 
 
 		 332 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 489 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 390 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 571 aa  99  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 1096 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 336 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  34.04 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  30.33 
 
 		 1170 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 713 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  30.96 
 
 		 561 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 		 1160 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.62 
 
 		 849 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 1170 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  30.97 
 
 		 717 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  30.48 
 
 		 480 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 499 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  27.62 
 
 		 1092 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 488 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 352 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  31.46 
 
 		 852 aa  95.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  29.79 
 
 		 478 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 384 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 1202 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 352 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 867 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 759 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 840 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 409 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 356 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 572 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 336 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1039 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  29.84 
 
 		 505 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 349 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 339 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  29.38 
 
 		 1165 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 512 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 586 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.96 
 
 		 1163 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  31.12 
 
 		 930 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  31.38 
 
 		 352 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  30.11 
 
 		 333 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 550 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 930 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  30 
 
 		 847 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 725 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  30 
 
 		 847 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 498 aa  89  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 416 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1124 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 		 856 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  30.05 
 
 		 500 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.5 
 
 		 847 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 929 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 500 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 934 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 717 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>