232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2366 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2366  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  53.48 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  54.26 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0197  putative signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1440  putative signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6262  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  44.1 
 
 		 1063 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  41.03 
 
 		 1061 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  39.36 
 
 		 692 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 856 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 792 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 571 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 352 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 1039 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 561 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 575 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 		 855 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 662 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 601 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 347 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 484 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  31.18 
 
 		 478 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 465 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  31.39 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 572 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 717 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.68 
 
 		 844 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 489 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 499 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 725 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.13 
 
 		 1190 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 1165 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 713 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 907 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  31.39 
 
 		 993 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 759 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.35 
 
 		 846 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  35.38 
 
 		 1202 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.55 
 
 		 844 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 579 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 635 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 1111 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 336 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 336 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 867 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  31.89 
 
 		 332 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 1096 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1132 aa  99  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  31.88 
 
 		 1132 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  33.5 
 
 		 352 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 346 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 1191 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  28.57 
 
 		 1170 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  32.8 
 
 		 856 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 1170 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1124 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  31.31 
 
 		 1096 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 850 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 588 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  30.65 
 
 		 480 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 460 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  30.65 
 
 		 842 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  31.35 
 
 		 852 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 488 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 512 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 344 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 555 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 384 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 488 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 364 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  31.94 
 
 		 872 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  32.85 
 
 		 717 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.85 
 
 		 1324 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 713 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 356 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 390 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 362 aa  95.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 583 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.18 
 
 		 847 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 313 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 550 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 498 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 929 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 409 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 633 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 488 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  32.09 
 
 		 360 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.18 
 
 		 847 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.96 
 
 		 1160 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 602 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  29.84 
 
 		 488 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  32.99 
 
 		 624 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 620 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  28.76 
 
 		 1003 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 583 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  33.67 
 
 		 655 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>