221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1440 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1440  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
239 aa  474  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6262  signal transduction histidine kinase  67.26 
 
 
238 aa  304  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0197  putative signal transduction histidine kinase  59.13 
 
 
239 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  49.36 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
234 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2366  signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 
225 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  48.7 
 
 
1063 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  47.87 
 
 
1061 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  47.59 
 
 
692 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
1111 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
484 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  35.53 
 
 
1096 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1096 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
336 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
792 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
713 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
1039 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  37.43 
 
 
326 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
572 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
575 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.22 
 
 
1190 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
717 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
929 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  34.41 
 
 
856 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
346 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
601 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
583 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
344 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
728 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
384 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  32.99 
 
 
728 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
583 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  31.09 
 
 
561 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  35.29 
 
 
500 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.36 
 
 
583 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
662 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.26 
 
 
842 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
500 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
850 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
588 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
725 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
713 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
907 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
334 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  34.18 
 
 
717 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
586 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
500 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
571 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  29.72 
 
 
856 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  28.87 
 
 
993 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
571 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
759 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
867 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
930 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
1202 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
347 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
352 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  30.85 
 
 
930 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
489 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
409 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
495 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
602 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
555 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
503 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
499 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
620 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.37 
 
 
846 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
1124 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.61 
 
 
1168 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
339 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  29.47 
 
 
1045 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  30.48 
 
 
478 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
387 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
390 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
934 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  31.86 
 
 
620 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
512 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
550 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
840 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
356 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.77 
 
 
1163 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  28.97 
 
 
332 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  28.11 
 
 
844 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.65 
 
 
849 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
635 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  29.02 
 
 
855 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
655 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  30.46 
 
 
655 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  29.56 
 
 
1092 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
488 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  29.63 
 
 
847 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  29.15 
 
 
1003 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  29.63 
 
 
847 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
1191 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
507 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>